Tahap kedua dari battle royale yang dikenal sebagai Rencana Sekirei sedang berlangsung. Shintou Teito telah ditutup; tidak ada Sekirei atau Ashikabi yang boleh pergi. Minato Sahashi dan harem Sekirei-nya kini harus bersiap untuk pertempuran baru seiring diberlakukannya perubahan aturan. Namun, tidak semua kelompok akan kembali bertempur: beberapa Sekirei sangat dicintai oleh rekan Ashikabi mereka, yang lebih memilih kehilangan hadiah daripada melihat mereka musnah.

Di tengah aksi tersebut, seseorang yang dekat dengan Minato mungkin terlibat lebih dari yang pernah dibayangkannya, dan ancaman mengintai di setiap sudut. Bahkan ada rumor bahwa "Single Numbers", tipe Sekirei terkuat, telah memasuki medan pertempuran. Di mata "Game Master" Minaka Hiroto, semuanya berjalan sesuai rencana.