Tiba-tiba, mereka datang: alien parasit yang turun ke Bumi dan dengan cepat menyusup ke dalam tubuh manusia dengan cara menggali ke dalam otak target yang rentan. Makhluk yang tidak pernah puas ini memperoleh kendali penuh atas inangnya dan dapat berubah menjadi berbagai bentuk untuk memangsa mangsa yang tidak menaruh curiga.

Shinichi Izumi, seorang siswa SMA berusia 16 tahun, menjadi korban salah satu parasit ini, namun parasit ini gagal mengambil alih otaknya dan berakhir di tangan kanannya. Karena tidak dapat berpindah tempat, parasit tersebut, yang sekarang bernama Migi, tidak memiliki pilihan selain bergantung pada Shinichi untuk tetap hidup. Dengan demikian, pasangan ini dipaksa untuk hidup berdampingan secara tidak nyaman dan harus mempertahankan diri dari parasit yang bermusuhan yang berharap untuk membasmi ancaman baru terhadap spesies mereka.