Dilemparkan ke sel isolasi setelah upaya penyelamatan yang nekat, Jolyne Kuujou berjuang untuk mengungkap rencana jahat Whitesnake, sebuah Stand musuh yang pemiliknya masih belum diketahui olehnya.

Pemilik Whitesnake ternyata adalah Enrico Pucci, seorang pastor sekaligus rohaniawan di Penjara Green Dolphin Street. Pucci memiliki ikatan yang dalam dengan seorang penjahat yang dulu pernah menghantui garis keturunan Joestar, menjadikan perseteruannya dengan Jolyne dan ayahnya, Joutarou, sebagai urusan pribadi. Dengan tekad untuk melaksanakan rencana utama sahabatnya yang telah tiada, Pucci memanfaatkan penjara beserta para tahanannya demi mewujudkan skema jahatnya.

Dengan bantuan sesama tahanan, seperti Ermes Costello dan Foo Fighters, Jolyne melawan berbagai pengguna Stand musuh. Saat dampak dari rencana Pucci menyebar melampaui batas penjara dan mulai mengancam seluruh dunia, Jolyne menerima warisan garis keturunannya dan mempertaruhkan nyawanya untuk mengakhiri kejahatan.